டெல்லா புரதங்கள் பாதுகாக்கப்பட்ட முதன்மை புரதங்கள் ஆகும்.வளர்ச்சி கட்டுப்பாட்டாளர்கள்உள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் சமிக்ஞைகளுக்கு ஏற்ப தாவர வளர்ச்சியைக் கட்டுப்படுத்துவதில் முக்கியப் பங்கு வகிக்கிறது. டெல்லா ஒரு படியெடுத்தல் ஒழுங்குபடுத்தியாகச் செயல்படுகிறது மற்றும் அதன் GRAS டொமைன் வழியாக படியெடுத்தல் காரணிகள் (TFs) மற்றும் ஹிஸ்டோன் H2A உடன் பிணைவதன் மூலம் இலக்கு ஊக்குவிப்பான்களுக்கு ஈர்க்கப்படுகிறது. சமீபத்திய ஆய்வுகள், டெல்லாவின் நிலைத்தன்மை இரண்டு வழிமுறைகள் மூலம் மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய முறையில் ஒழுங்குபடுத்தப்படுகிறது என்பதைக் காட்டுகின்றன: தாவர ஹார்மோனான கிப்பரெல்லினால் தூண்டப்படும் பாலியூபிகுயிட்டினேஷன், இது அதன் விரைவான சிதைவுக்கு வழிவகுக்கிறது, மற்றும் அதன் திரட்சியை அதிகரிக்க சிறிய யூபிகுயின் போன்ற மாற்றிகளின் (SUMO) இணைவு. கூடுதலாக, டெல்லாவின் செயல்பாடு இரண்டு வெவ்வேறு கிளைகோசைலேஷன்களால் மாறும் வகையில் ஒழுங்குபடுத்தப்படுகிறது: டெல்லா-TF இடைவினை O-ஃபுகோசைலேஷனால் மேம்படுத்தப்படுகிறது, ஆனால் O-இணைக்கப்பட்ட N-அசிடைல்குளுகோசமைன் (O-GlcNAc) மாற்றியமைப்பால் தடுக்கப்படுகிறது. இருப்பினும், டெல்லா பாஸ்போரிலேஷனின் பங்கு தெளிவாக இல்லை, ஏனெனில் முந்தைய ஆய்வுகள் முரண்பாடான முடிவுகளைக் காட்டியுள்ளன; பாஸ்போரிலேஷன் டெல்லா சிதைவை ஊக்குவிக்கிறது அல்லது குறைக்கிறது என்பதைக் காட்டும் ஆய்வுகளிலிருந்து, பாஸ்போரிலேஷன் அதன் நிலைத்தன்மையை பாதிக்காது என்பதைக் காட்டும் மற்ற ஆய்வுகள் வரை அவை வேறுபடுகின்றன. இங்கே, ரெப்ரஸரில் உள்ள பாஸ்போரிலேஷன் தளங்களை நாங்கள் அடையாளம் காண்கிறோம்.ga1-3அரபிடாப்சிஸ் தாலியானாவிலிருந்து நிறை நிறமாலை பகுப்பாய்வு மூலம் தூய்மைப்படுத்தப்பட்ட (RGA, AtDELLA) மூலக்கூறுகளின் பாஸ்போரைலேஷன், பாலிஎஸ் (PolyS) மற்றும் பாலிஎஸ்/டி (PolyS/T) பகுதிகளில் இரண்டு RGA பெப்டைடுகளின் பாஸ்போரைலேஷன், H2A பிணைப்பை ஊக்குவித்து RGA செயல்பாட்டை மேம்படுத்துகிறது என்பதைக் காட்டுகிறது. இலக்கு ஊக்குவிப்பான்களுடன் RGA-வின் தொடர்பு. குறிப்பிடத்தக்க வகையில், பாஸ்போரைலேஷன் ஆனது RGA-TF இடைவினைகளையோ அல்லது RGA நிலைத்தன்மையையோ பாதிப்பதில்லை. பாஸ்போரைலேஷன் மூலம் டெல்லா (DELLA) செயல்பாடு தூண்டப்படும் மூலக்கூறு வழிமுறையை எங்கள் ஆய்வு வெளிப்படுத்துகிறது.
டெல்லா (DELLA) செயல்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துவதில் பாஸ்போரிலேஷனின் பங்கைத் தெளிவுபடுத்துவதற்கு, உயிருள்ள தாவரங்களில் டெல்லா பாஸ்போரிலேஷன் தளங்களைக் கண்டறிவதும், செயல்பாட்டுப் பகுப்பாய்வுகளை மேற்கொள்வதும் மிகவும் அவசியமாகும். தாவரச் சாறுகளைப் பிணைப்புவழித் தூய்மைப்படுத்தல் செய்து, அதைத் தொடர்ந்து MS/MS பகுப்பாய்வு செய்ததன் மூலம், நாங்கள் RGA-வில் பல பாஸ்போசைட்டுகளைக் கண்டறிந்தோம். GA குறைபாடுள்ள சூழ்நிலைகளில், RHA பாஸ்போரிலேஷன் அதிகரிக்கிறது, ஆனால் பாஸ்போரிலேஷன் அதன் நிலைத்தன்மையைப் பாதிப்பதில்லை. முக்கியமாக, கோ-ஐபி (co-IP) மற்றும் சிஎச்ஐபி-கியூபிசிஆர் (ChIP-qPCR) சோதனைகள், RGA-வின் பாலிஎஸ்/டி (PolyS/T) பகுதியில் ஏற்படும் பாஸ்போரிலேஷன், H2A உடனான அதன் இடைவினையையும் இலக்கு ஊக்குவிப்பான்களுடனான அதன் இணைப்பையும் ஊக்குவிக்கிறது என்பதை வெளிப்படுத்தின. இதன்மூலம், பாஸ்போரிலேஷன் RGA செயல்பாட்டைத் தூண்டும் வழிமுறை வெளிப்படுகிறது.
LHR1 துணைப்பகுதியின் TF உடனான இடைச்செயல் மூலம் RGA இலக்கு குரோமாடினுக்குள் ஈர்க்கப்படுகிறது, பின்னர் அதன் PolyS/T பகுதி மற்றும் PFYRE துணைப்பகுதி வழியாக H2A உடன் பிணைந்து, RGA-வை நிலைப்படுத்த H2A-RGA-TF கூட்டுச்சேர்மத்தை உருவாக்குகிறது. DELLA பகுதிக்கும் GRAS பகுதிக்கும் இடையேயான PolyS/T பகுதியில் உள்ள Pep 2-ஐ, அடையாளம் காணப்படாத ஒரு கைனேஸ் மூலம் பாஸ்போரிலேற்றம் செய்வது RGA-H2A பிணைப்பை மேம்படுத்துகிறது. rgam2A சடுதிமாற்றப் புரதமானது RGA பாஸ்போரிலேற்றத்தை நீக்கி, H2A பிணைப்பில் குறுக்கிடுவதற்காக ஒரு வேறுபட்ட புரத வடிவத்தை ஏற்கிறது. இது தற்காலிக TF-rgam2A இடைச்செயல்களின் நிலைத்தன்மையின்மைக்கும், இலக்கு குரோமாடினிலிருந்து rgam2A பிரிந்து செல்வதற்கும் வழிவகுக்கிறது. இந்தப் படம் RGA-வால் தூண்டப்பட்ட படியெடுத்தல் ஒடுக்கத்தை மட்டுமே சித்தரிக்கிறது. RGA-வால் தூண்டப்பட்ட படியெடுத்தல் செயலாக்கத்திற்கும் இதேபோன்ற ஒரு வடிவத்தை விவரிக்க முடியும், ஆனால் H2A-RGA-TF கூட்டுச்சேர்மம் இலக்கு மரபணுவின் படியெடுத்தலை ஊக்குவிக்கும் மற்றும் rgam2A-வின் பாஸ்போரிலேற்ற நீக்கம் படியெடுத்தலைக் குறைக்கும். படம் Huang et al.21-இலிருந்து மாற்றியமைக்கப்பட்டது.
அனைத்து அளவுசார் தரவுகளும் எக்செல் (Excel) மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி புள்ளிவிவர ரீதியாகப் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன, மேலும் குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் ஸ்டூடண்ட்ஸ் டி டெஸ்ட் (Student's t test) மூலம் கண்டறியப்பட்டன. மாதிரி அளவை முதற்கட்டமாகத் தீர்மானிக்க எந்தப் புள்ளிவிவர முறைகளும் பயன்படுத்தப்படவில்லை. பகுப்பாய்விலிருந்து எந்தத் தரவும் விலக்கப்படவில்லை; இந்தச் சோதனை சீரற்ற முறையில் நடத்தப்படவில்லை; சோதனையின் போதும் முடிவுகளின் மதிப்பீட்டின் போதும் தரவுகளின் பரவல் குறித்து ஆராய்ச்சியாளர்களுக்குத் தெரியாமல் இருக்கவில்லை. மாதிரி அளவு, பட விளக்கத்திலும் மூலத் தரவுக் கோப்பிலும் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது.
ஆய்வு வடிவமைப்பு பற்றிய கூடுதல் தகவல்களுக்கு, இந்தக் கட்டுரையுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ள இயற்கை தொகுப்பு அறிக்கை சுருக்கத்தைப் பார்க்கவும்.
நிறை நிறமாலை புரோட்டியோமிக்ஸ் தரவுகள், PXD046004 என்ற தரவுத்தொகுப்பு அடையாளங்காட்டியுடன் PRIDE66 கூட்டாளர் களஞ்சியத்தின் வழியாக ProteomeXchange கூட்டமைப்பிற்கு வழங்கப்பட்டுள்ளன. இந்த ஆய்வின் போது பெறப்பட்ட மற்ற அனைத்து தரவுகளும் துணைத் தகவல், துணைத் தரவுக் கோப்புகள் மற்றும் மூலத் தரவுக் கோப்புகளில் வழங்கப்பட்டுள்ளன. இந்தக் கட்டுரைக்கான மூலத் தரவுகள் வழங்கப்பட்டுள்ளன.
பதிவிட்ட நேரம்: நவம்பர்-08-2024
