விசாரணைபிஜி

குரோமாடினுடன் ஹிஸ்டோன் H2A இன் தொடர்பை ஊக்குவிப்பதன் மூலம், அரபிடோப்சிஸில் பாஸ்போரிலேஷன் முதன்மை வளர்ச்சி சீராக்கி DELLA ஐ செயல்படுத்துகிறது.

டெல்லா புரதங்கள் பாதுகாக்கப்பட்ட மாஸ்டர் ஆகும்.வளர்ச்சி கட்டுப்பாட்டாளர்கள்உள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் குறிப்புகளுக்கு பதிலளிக்கும் விதமாக தாவர வளர்ச்சியைக் கட்டுப்படுத்துவதில் அவை முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன. DELLA ஒரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரெகுலேட்டராக செயல்படுகிறது மற்றும் அதன் GRAS டொமைன் மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் (TFகள்) மற்றும் ஹிஸ்டோன் H2A உடன் பிணைப்பதன் மூலம் இலக்கு ஊக்குவிப்பாளர்களுக்கு ஆட்சேர்ப்பு செய்யப்படுகிறது. சமீபத்திய ஆய்வுகள், DELLA நிலைத்தன்மை இரண்டு வழிமுறைகள் மூலம் மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிறகு கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது என்பதைக் காட்டுகின்றன: பைட்டோஹார்மோன் கிபெரெல்லின் மூலம் தூண்டப்படும் பாலியூபிக்விடினேஷன், இது அதன் விரைவான சிதைவுக்கு வழிவகுக்கிறது, மற்றும் அதன் திரட்சியை அதிகரிக்க சிறிய யூபிக்விடின் போன்ற மாற்றியமைப்பாளர்களின் (SUMO) இணைப்பு. கூடுதலாக, DELLA செயல்பாடு இரண்டு வெவ்வேறு கிளைகோசைலேஷன்களால் மாறும் வகையில் கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது: DELLA-TF தொடர்பு O-fucosylation மூலம் மேம்படுத்தப்படுகிறது, ஆனால் O-இணைக்கப்பட்ட N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) மாற்றத்தால் தடுக்கப்படுகிறது. இருப்பினும், DELLA பாஸ்போரிலேஷனின் பங்கு தெளிவாக இல்லை, ஏனெனில் முந்தைய ஆய்வுகள் முரண்பாடான முடிவுகளைக் காட்டியுள்ளன, பாஸ்போரிலேஷன் DELLA சிதைவை ஊக்குவிக்கிறது அல்லது குறைக்கிறது என்பதைக் காட்டும் மற்றவர்களுக்கு பாஸ்போரிலேஷன் அதன் நிலைத்தன்மையை பாதிக்காது என்பதைக் காட்டுகிறது. இங்கே, REPRESSOR இல் பாஸ்போரிலேஷன் தளங்களை நாங்கள் அடையாளம் காண்கிறோம்.ga1-3(RGA, AtDELLA) மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி பகுப்பாய்வு மூலம் அரபிடோப்சிஸ் தலியானாவிலிருந்து சுத்திகரிக்கப்பட்டு, பாலிஎஸ் மற்றும் பாலிஎஸ்/டி பகுதிகளில் இரண்டு RGA பெப்டைட்களின் பாஸ்போரிலேஷன் H2A பிணைப்பை ஊக்குவிக்கிறது மற்றும் மேம்படுத்தப்பட்ட RGA செயல்பாட்டைக் காட்டுகிறது. இலக்கு ஊக்கிகளுடன் RGA இன் தொடர்பு. குறிப்பாக, பாஸ்போரிலேஷன் RGA-TF தொடர்புகளையோ அல்லது RGA நிலைத்தன்மையையோ பாதிக்காது. பாஸ்போரிலேஷன் DELLA செயல்பாட்டைத் தூண்டும் மூலக்கூறு பொறிமுறையை எங்கள் ஆய்வு வெளிப்படுத்துகிறது.
DELLA செயல்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துவதில் பாஸ்போரிலேஷனின் பங்கை தெளிவுபடுத்த, DELLA பாஸ்போரிலேஷனின் தளங்களை உயிரியல் ரீதியாக அடையாளம் கண்டு தாவரங்களில் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்வுகளைச் செய்வது மிகவும் முக்கியம். MS/MS பகுப்பாய்வைத் தொடர்ந்து தாவர சாறுகளின் இணைப்பு சுத்திகரிப்பு மூலம், RGA இல் பல பாஸ்போசைட்டுகளை நாங்கள் அடையாளம் கண்டோம். GA குறைபாட்டின் நிலைமைகளின் கீழ், RHA பாஸ்போரிலேஷனை அதிகரிக்கிறது, ஆனால் பாஸ்போரிலேஷனை அதன் நிலைத்தன்மை பாதிக்காது. முக்கியமாக, இணை-IP மற்றும் ChIP-qPCR மதிப்பீடுகள், RGA இன் PolyS/T பகுதியில் பாஸ்போரிலேஷனை H2A உடனான அதன் தொடர்பு மற்றும் இலக்கு ஊக்குவிப்பாளர்களுடனான அதன் தொடர்பை ஊக்குவிக்கிறது, பாஸ்போரிலேஷனை RGA செயல்பாட்டைத் தூண்டும் வழிமுறையை வெளிப்படுத்துகிறது.
LHR1 துணை டொமைனை TF உடனான தொடர்பு மூலம் இலக்கு குரோமாடினுக்கு RGA சேர்க்கப்படுகிறது, பின்னர் அதன் PolyS/T பகுதி மற்றும் PFYRE துணை டொமைன் மூலம் H2A உடன் பிணைக்கப்பட்டு, RGA ஐ நிலைப்படுத்த H2A-RGA-TF வளாகத்தை உருவாக்குகிறது. DELLA டொமைன் மற்றும் GRAS டொமைனுக்கு இடையில் அடையாளம் காணப்படாத கைனேஸ் மூலம் PolyS/T பகுதியில் Pep 2 இன் பாஸ்போரிலேஷன் RGA-H2A பிணைப்பை மேம்படுத்துகிறது. rgam2A விகாரமான புரதம் RGA பாஸ்போரிலேஷனை ஒழித்து, H2A பிணைப்பில் தலையிட வேறுபட்ட புரத இணக்கத்தை ஏற்றுக்கொள்கிறது. இதன் விளைவாக நிலையற்ற TF-rgam2A தொடர்புகள் நிலைத்தன்மையை இழக்கின்றன மற்றும் இலக்கு குரோமாடினிலிருந்து rgam2A பிரிகிறது. இந்த எண்ணிக்கை RGA- மத்தியஸ்த டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் அடக்குமுறையை மட்டுமே சித்தரிக்கிறது. H2A-RGA-TF சிக்கலானது இலக்கு மரபணு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை ஊக்குவிக்கும் மற்றும் rgam2A இன் டிபாஸ்போரிலேஷன் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைக் குறைக்கும் என்பதைத் தவிர, RGA- மத்தியஸ்த டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் செயல்படுத்தலுக்கும் இதே போன்ற வடிவத்தை விவரிக்க முடியும். ஹுவாங் மற்றும் பலர்.21 இலிருந்து படம் மாற்றியமைக்கப்பட்டது.
அனைத்து அளவு தரவுகளும் எக்செல் பயன்படுத்தி புள்ளிவிவர ரீதியாக பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன, மேலும் மாணவர்களின் டி சோதனையைப் பயன்படுத்தி குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் தீர்மானிக்கப்பட்டன. மாதிரி அளவை முதற்கட்டமாக தீர்மானிக்க எந்த புள்ளிவிவர முறைகளும் பயன்படுத்தப்படவில்லை. பகுப்பாய்விலிருந்து எந்த தரவும் விலக்கப்படவில்லை; சோதனை சீரற்றதாக மாற்றப்படவில்லை; பரிசோதனையின் போது தரவு விநியோகம் மற்றும் முடிவுகளின் மதிப்பீட்டை ஆராய்ச்சியாளர்கள் கவனிக்கவில்லை. மாதிரி அளவு படம் லெஜண்ட் மற்றும் மூல தரவு கோப்பில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது.
ஆய்வு வடிவமைப்பு பற்றிய கூடுதல் தகவலுக்கு, இந்தக் கட்டுரையுடன் தொடர்புடைய இயற்கை போர்ட்ஃபோலியோ அறிக்கை சுருக்கத்தைப் பார்க்கவும்.
PXD046004 என்ற தரவுத்தொகுப்பு அடையாளங்காட்டியுடன் கூடிய PRIDE66 கூட்டாளர் களஞ்சியம் மூலம் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி புரோட்டியோமிக்ஸ் தரவு புரோட்டியோம்எக்ஸ்சேஞ்ச் கூட்டமைப்பிற்கு பங்களிக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த ஆய்வின் போது பெறப்பட்ட மற்ற அனைத்து தரவுகளும் துணைத் தகவல், துணைத் தரவு கோப்புகள் மற்றும் மூலத் தரவு கோப்புகளில் வழங்கப்பட்டுள்ளன. இந்தக் கட்டுரைக்கான மூலத் தரவு வழங்கப்படுகிறது.

 

இடுகை நேரம்: நவம்பர்-08-2024