எத்தியோப்பியாவின் அவாஷ், செபாட்கிலோவில் உள்ள அனோபிலிஸ் கொசுக்களில் பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பின் மரபணு அளவிலான மக்கள்தொகை மரபியல் மற்றும் மூலக்கூறு கண்காணிப்பு.

2012 ஆம் ஆண்டு ஜிபூட்டியில் கண்டுபிடிக்கப்பட்டதிலிருந்து, ஆசிய அனோபிலிஸ் ஸ்டீபன்சி கொம்பு ஆப்பிரிக்காவின் கொம்பு முழுவதும் பரவியுள்ளது. இந்த ஆக்கிரமிப்பு நோய் பரப்பி கண்டம் முழுவதும் தொடர்ந்து பரவி வருகிறது, இது மலேரியா கட்டுப்பாட்டு திட்டங்களுக்கு கடுமையான அச்சுறுத்தலை ஏற்படுத்துகிறது. பூச்சிக்கொல்லி சிகிச்சையளிக்கப்பட்ட படுக்கை வலைகள் மற்றும் உட்புற எச்ச தெளித்தல் உள்ளிட்ட நோய் பரப்பி கட்டுப்பாட்டு முறைகள் மலேரியா சுமையை கணிசமாகக் குறைத்துள்ளன. இருப்பினும், அனோபிலிஸ் ஸ்டீபன்சி மக்கள் தொகை உட்பட பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பு கொசுக்களின் அதிகரித்து வரும் பரவல், தற்போதைய மலேரியா ஒழிப்பு முயற்சிகளைத் தடுக்கிறது. பயனுள்ள மலேரியா கட்டுப்பாட்டு உத்திகளை வழிநடத்த மக்கள்தொகை அமைப்பு, மக்களிடையே மரபணு ஓட்டம் மற்றும் பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பு பிறழ்வுகளின் விநியோகம் ஆகியவற்றைப் புரிந்துகொள்வது அவசியம்.
HOA-வில் ஆன். ஸ்டீபன்சி எவ்வாறு இவ்வளவு நிலைபெற்றது என்பது பற்றிய நமது புரிதலை மேம்படுத்துவது, புதிய பகுதிகளுக்கு அதன் பரவலை முன்னறிவிப்பதற்கு மிகவும் முக்கியமானது. மக்கள்தொகை அமைப்பு, தொடர்ச்சியான தேர்வு மற்றும் மரபணு ஓட்டம் பற்றிய நுண்ணறிவைப் பெற, திசையன் இனங்களைப் படிக்க மக்கள்தொகை மரபியல் விரிவாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது. ஆன். ஸ்டீபன்சியைப் பொறுத்தவரை, மக்கள்தொகை அமைப்பு மற்றும் மரபணு அமைப்பைப் படிப்பது அதன் படையெடுப்பு பாதையையும் அதன் தோற்றத்திலிருந்து ஏற்பட்டிருக்கக்கூடிய எந்தவொரு தகவமைப்பு பரிணாமத்தையும் தெளிவுபடுத்த உதவும். மரபணு ஓட்டத்திற்கு கூடுதலாக, தேர்வு மிகவும் முக்கியமானது, ஏனெனில் இது பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்புடன் தொடர்புடைய அல்லீல்களை அடையாளம் காண முடியும் மற்றும் இந்த அல்லீல்கள் மக்கள்தொகையில் எவ்வாறு பரவுகின்றன என்பதை வெளிச்சம் போட்டுக் காட்ட முடியும்20.
இன்றுவரை, ஆக்கிரமிப்பு இனமான அனோபிலிஸ் ஸ்டீபன்சியில் பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பு குறிப்பான்கள் மற்றும் மக்கள்தொகை மரபியல் சோதனை ஒரு சில வேட்பாளர் மரபணுக்களுக்கு மட்டுமே வரையறுக்கப்பட்டுள்ளது. ஆப்பிரிக்காவில் இனங்கள் தோன்றுவது முழுமையாகப் புரிந்து கொள்ளப்படவில்லை, ஆனால் ஒரு கருதுகோள் என்னவென்றால், அது மனிதர்கள் அல்லது கால்நடைகளால் அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது. மற்ற கோட்பாடுகளில் காற்றின் மூலம் நீண்ட தூர இடம்பெயர்வு அடங்கும். இந்த ஆய்வில் பயன்படுத்தப்படும் எத்தியோப்பியன் தனிமைப்படுத்தல்கள் அடிஸ் அபாபாவிலிருந்து 200 கிமீ கிழக்கே மற்றும் அடிஸ் அபாபாவிலிருந்து ஜிபூட்டி வரையிலான முக்கிய போக்குவரத்து வழித்தடத்தில் அமைந்துள்ள அவாஷ் செபாட் கிலோ என்ற நகரத்தில் சேகரிக்கப்பட்டன. அவாஷ் செபாட் கிலோ என்பது அதிக மலேரியா பரவும் ஒரு பகுதி மற்றும் அனோபிலிஸ் ஸ்டீபன்சியின் அதிக மக்கள்தொகையைக் கொண்டுள்ளது, இது பூச்சிக்கொல்லிகளுக்கு எதிர்ப்புத் திறன் கொண்டதாகக் கூறப்படுகிறது, இது அனோபிலிஸ் ஸ்டீபன்சியின் மக்கள்தொகை மரபியலைப் படிப்பதற்கான ஒரு முக்கியமான தளமாக அமைகிறது8.
எத்தியோப்பியன் மக்கள்தொகையில் பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பு பிறழ்வு kdr L1014F குறைந்த அதிர்வெண்ணில் கண்டறியப்பட்டது மற்றும் இந்திய கள மாதிரிகளில் கண்டறியப்படவில்லை. இந்த kdr பிறழ்வு பைரெத்ராய்டுகள் மற்றும் DDT க்கு எதிர்ப்பை வழங்குகிறது மற்றும் முன்னர் 2016 இல் இந்தியாவிலும் 2018 இல் ஆப்கானிஸ்தானிலும் சேகரிக்கப்பட்ட An. ஸ்டீபன்சி மக்கள்தொகையில் கண்டறியப்பட்டது. 31,32 இரு நகரங்களிலும் பரவலான பைரெத்ராய்டு எதிர்ப்பின் சான்றுகள் இருந்தபோதிலும், இங்கே பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட மங்களூர் மற்றும் பெங்களூரு மக்கள்தொகையில் kdr L1014F பிறழ்வு கண்டறியப்படவில்லை. இந்த SNP ஐ சுமந்து செல்லும் எத்தியோப்பியன் தனிமைப்படுத்தல்களின் குறைந்த விகிதம், இந்த மக்கள்தொகையில் சமீபத்தில் பிறழ்வு எழுந்தது என்பதைக் குறிக்கிறது. இதற்கு ஆதாரமாக, அவாஷில் நடத்தப்பட்ட முந்தைய ஆய்வு, இங்கு பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட மாதிரிகளுக்கு முந்தைய ஆண்டில் சேகரிக்கப்பட்ட மாதிரிகளில் kdr பிறழ்வுக்கான எந்த ஆதாரமும் இல்லை.18 ஆம்பிளிகான் கண்டறிதல் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி அதே பகுதி/ஆண்டு மாதிரிகளின் தொகுப்பில் குறைந்த அதிர்வெண்ணில் இந்த kdr L1014F பிறழ்வை நாங்கள் முன்னர் அடையாளம் கண்டோம்.28 மாதிரி தளங்களில் பினோடைபிக் எதிர்ப்பைக் கருத்தில் கொண்டு, இந்த எதிர்ப்பு மார்க்கரின் குறைந்த அல்லீல் அதிர்வெண், இலக்கு தள மாற்றத்தைத் தவிர வேறு வழிமுறைகள் இந்த கவனிக்கப்பட்ட பினோடைப்பிற்குக் காரணம் என்று கூறுகிறது.
பூச்சிக்கொல்லி பதிலில் பினோடைபிக் தரவு இல்லாதது இந்த ஆய்வின் ஒரு வரம்பாகும். பூச்சிக்கொல்லி பதிலில் இந்த பிறழ்வுகளின் தாக்கத்தை ஆராய, முழு மரபணு வரிசைமுறை (WGS) அல்லது இலக்கு ஆம்பிளிகான் வரிசைமுறையை இணைந்து உணர்திறன் உயிரியல் பகுப்பாய்வுகளுடன் இணைக்கும் கூடுதல் ஆய்வுகள் தேவை. எதிர்ப்புடன் தொடர்புடையதாக இருக்கக்கூடிய இந்த புதிய மிஸ்சென்ஸ் SNPகள், கண்காணிப்பை ஆதரிக்கவும், எதிர்ப்பு பினோடைப்களுடன் தொடர்புடைய சாத்தியமான வழிமுறைகளைப் புரிந்துகொண்டு சரிபார்க்க செயல்பாட்டுப் பணிகளை எளிதாக்கவும் உயர்-செயல்திறன் மூலக்கூறு மதிப்பீடுகளுக்கு இலக்காக வேண்டும்.
சுருக்கமாக, இந்த ஆய்வு கண்டங்கள் முழுவதும் அனோபிலிஸ் கொசுக்களின் எண்ணிக்கை மரபியல் பற்றிய ஆழமான புரிதலை வழங்குகிறது. வெவ்வேறு புவியியல் பகுதிகளில் உள்ள பெரிய மாதிரி குழுக்களுக்கு முழு மரபணு வரிசைமுறை (WGS) பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்துவது மரபணு ஓட்டத்தைப் புரிந்துகொள்வதற்கும் பூச்சிக்கொல்லி எதிர்ப்பின் குறிப்பான்களை அடையாளம் காண்பதற்கும் முக்கியமாகும். இந்த அறிவு பொது சுகாதார அதிகாரிகள் நோய்க்கிருமி கண்காணிப்பு மற்றும் பூச்சிக்கொல்லி பயன்பாட்டில் தகவலறிந்த தேர்வுகளை செய்ய உதவும்.
இந்த தரவுத்தொகுப்பில் நகல் எண் மாறுபாட்டைக் கண்டறிய இரண்டு அணுகுமுறைகளைப் பயன்படுத்தினோம். முதலில், மரபணுவில் அடையாளம் காணப்பட்ட CYP மரபணு கொத்துக்களை மையமாகக் கொண்ட ஒரு கவரேஜ் அடிப்படையிலான அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தினோம் (துணை அட்டவணை S5). மாதிரி கவரேஜ் சேகரிப்பு இடங்களில் சராசரியாகக் கணக்கிடப்பட்டு நான்கு குழுக்களாகப் பிரிக்கப்பட்டது: எத்தியோப்பியா, இந்திய வயல்கள், இந்திய காலனிகள் மற்றும் பாகிஸ்தான் காலனிகள். ஒவ்வொரு குழுவிற்கும் கவரேஜ் கர்னல் மென்மையாக்கலைப் பயன்படுத்தி இயல்பாக்கப்பட்டது, பின்னர் அந்தக் குழுவிற்கான சராசரி மரபணு கவரேஜ் ஆழத்தின் படி திட்டமிடப்பட்டது.